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PEDV、PoRVA和PDCoV TaqMan三重RT-qPCR检测方法的建立与初步应用

Establishment and Preliminary Application of PEDV,PoRVA and PDCoV TaqMan Triple RT-qPCR Assay

摘要旨在建立一种可快速同时检测猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、猪A群轮状病毒(porcine rotavirus type A,PoRVA)和猪丁型冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)三重荧光定量PCR方法.针对PEDV-N、PoRVA-VP6和PDCoV-M基因设计了引物和探针,条件优化后进行性能评估,并与商品化试剂盒检测对比.结果显示:本研究建立的三重RT-qPCR方法具有良好特异性,对PRRSV、PCV2和PRV等阳性核酸不发生扩增;具有较高的敏感性,PEDV、PoRVA和PDCoV的最低检测限均达1 copies·μL-1;重复性良好,组内和组间变异系数均小于1%;样本适应性广,检测不同样本类型时,变异系数均小于1%.与商品化试剂盒对比,本研究建立的方法PEDV和PoRVA的检测符合率为92.5%和97.5%,并对PDCoV的检测范围更广,对其变异毒株仍有较好的检测效果.本研究建立的检测方法具有特异性好、敏感性高、稳定性强和样本适应性广等优势,为临床腹泻样本提供了一种好的检测方法.

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作者 胡泽奇 [1] 李润成 [1] 谭祖明 [2] 谢秀艳 [1] 王江平 [3] 秦乐娟 [3] 李荣 [3] 葛猛 [1] 学术成果认领
作者单位 湖南农业大学动物医学院,长沙 410000 [1] 茶陵县畜牧水产事务中心,茶陵 412400 [2] 湖南龙华农牧发展有限公司,茶陵 412400 [3]
分类号 S858.285.3
栏目名称 研究简报
DOI 10.11843/j.issn.0366-6964.2024.05.044
发布时间 2024-06-17
基金项目
湖南省重点研发计划项目 云南省重大科技专项计划 湖南省教育厅重点项目 湖南省普通高等学校科技创新团队支持计划
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