PEDV、PoRVA和PDCoV TaqMan三重RT-qPCR检测方法的建立与初步应用
Establishment and Preliminary Application of PEDV,PoRVA and PDCoV TaqMan Triple RT-qPCR Assay
摘要旨在建立一种可快速同时检测猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、猪A群轮状病毒(porcine rotavirus type A,PoRVA)和猪丁型冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)三重荧光定量PCR方法.针对PEDV-N、PoRVA-VP6和PDCoV-M基因设计了引物和探针,条件优化后进行性能评估,并与商品化试剂盒检测对比.结果显示:本研究建立的三重RT-qPCR方法具有良好特异性,对PRRSV、PCV2和PRV等阳性核酸不发生扩增;具有较高的敏感性,PEDV、PoRVA和PDCoV的最低检测限均达1 copies·μL-1;重复性良好,组内和组间变异系数均小于1%;样本适应性广,检测不同样本类型时,变异系数均小于1%.与商品化试剂盒对比,本研究建立的方法PEDV和PoRVA的检测符合率为92.5%和97.5%,并对PDCoV的检测范围更广,对其变异毒株仍有较好的检测效果.本研究建立的检测方法具有特异性好、敏感性高、稳定性强和样本适应性广等优势,为临床腹泻样本提供了一种好的检测方法.
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