阿霉素处理后对犬乳腺肿瘤细胞系CHMp lncRNAs差异表达的影响
The Effect of Doxorubicin Treatment on the Differential Expression of lncRNAs in Canine Mammary Tumor CHMp Cell Line
摘要旨在探究阿霉素对犬乳腺肿瘤细胞中lncRNAs分子的影响,寻找犬乳腺肿瘤潜在生物标志物和治疗靶点,本试验采用RNA-Seq技术对经阿霉素处理的犬乳腺肿瘤细胞进行转录组测序分析,筛选差异表达lncRNAs,应用GO富集和KEGG富集分析进行基因功能和途径注释并验证其表达情况.结果显示,经阿霉素处理后的犬乳腺肿瘤细胞中共有277个差异表达的lncRNAs,其中,147个表达上调,130个表达下调,主要涉及细胞新陈代谢、转录程序失调、ECM受体相互作用以及细胞坏死性凋亡等生物学过程.实时荧光定量PCR技术随机检测3个差异表达的lncRNAs,其表达趋势与RNA-Seq 一致,表明RNA-Seq测序结果的准确性.本研究基于转录组学技术,综合分析阿霉素抗犬乳腺肿瘤细胞相关lncRNAs表达变化的整体特征,揭示其可能的调控新机制,为犬乳腺肿瘤的靶向治疗和潜在生物标志物的开发利用提供参考.
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