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基于RPA-CRISPR/Cas12a的MSTN基因编辑猪检测方法的建立及应用

Establishment and Application of A Detection Method for MSTN Gene-Edited Pigs Based on RPA-CRISPR/Cas12a

摘要旨在建立一种基于重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA)和成簇规律间隔短回文重复序列/CRISPR 相关蛋白 12a(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associ-ated protein 12a,CRISPR/Cas12a)系统的MSTN基因编辑猪检测方法,以满足基因编辑动物研发、育种等过程中核酸检测以及基因型鉴定的需求.本研究构建含有猪MSTN基因突变序列和野生型序列的标准质粒并设计靶向标准质粒的crRNA,基于RPA和CRISPR/Cas12a技术建立荧光报告和胶体金试纸条检测体系,筛选特异性识别标准质粒的crRNA、优化其反应条件并评价其检测灵敏度,最后通过检测猪耳组织样品评价本方法的准确性和稳定性.研究结果表明,该方法能够特异性识别MSTN基因2 bp碱基缺失序列和MSTN 基因野生型序列.荧光报告体系最低可检测到4.1×101 copies·μL-的标准质粒,胶体金试纸条体系最低可检测到4.1×103 copies·μL-1的标准质粒.通过对猪耳组织样本的检测,证明了该检测体系的准确性和可靠性.综上所述,本研究建立的MSTN基因编辑猪RPA-CRISPR/Cas12a检测方法具有操作简便、特异性和灵敏度高的特点,为MSTN基因编辑猪检测提供了重要技术支撑,具有广阔的应用前景.

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作者 迟顺顺 [1] 吴丹 [2] 王楠 [3] 王婉洁 [4] 聂雨欣 [4] 牟玉莲 [4] 刘志国 [4] 朱振东 [5] 李奎 [3] 学术成果认领
作者单位 青岛农业大学动物科技学院,青岛 266109;中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所,岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心,农业农村部畜禽生物组学重点实验室,深圳 518124;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193 [1] 天津市宁河原种猪场有限责任公司,天津 301504 [2] 中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所,岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心,农业农村部畜禽生物组学重点实验室,深圳 518124;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193 [3] 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193 [4] 青岛农业大学动物科技学院,青岛 266109 [5]
分类号 S828.2
栏目名称
DOI 10.11843/j.issn.0366-6964.2025.08.016
发布时间 2025-09-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
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畜牧兽医学报

畜牧兽医学报

2025年56卷8期

3734-3748页

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