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大白猪生长性状的全基因组关联分析

Genome-wide Association Study of Growth Traits in Large White Pigs

摘要旨在通过全基因组关联分析(GWAS)解析大白猪关键生长性状的遗传机制,为分子标记辅助育种提供理论依据.本研究以5 701头大白猪为研究对象,采集猪达100kg体重日龄(AGE)、达100 kg体重背膘厚(BF)及达100 kg体重眼肌面积(LMA)的表型数据,结合Illumina 50K SNP芯片基因分型数据,采用混合线性模型进行全基因组关联分析,鉴定与猪生长性状相关的SNPs与候选基因.结果表明:AGE、BF和LMA遗传力分别为0.50、0.45和0.43,均属中高遗传力性状,AGE与BF的遗传相关系数为-0.13,表型相关系数为-0.20;AGE与LMA的遗传相关系数为-0.09,表型相关系数为-0.31;BF与LMA的遗传相关系数为0.22,表型相关系数为0.06;GWAS分析共鉴定出13个显著SNPs,其中AGE鉴定出8个显著SNPs,关联到PIK3CG等11个候选基因;BF鉴定出3个显著 SNPs,关联到IFN-ALPHA-15等6个候选基因;LMA 鉴定出2个显著 SNPs,关联到ALDH6A1基因.本研究通过长白猪生长性状的GWAS鉴定了PIK3CG、ELOVL2、IFN-ALPHA-15和AL-DH6A1等20个与猪生长性状相关的候选基因.研究结果为猪生长性状的分子标记辅助选择育种提供了重要参考.

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畜牧兽医学报

畜牧兽医学报

2025年56卷12期

6094-6103页

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