一株牛源变栖克雷伯菌噬菌体的分离鉴定、生物学特性及全基因组分析
Isolation and Identification,Biological Properties,and Whole-genome Analysis of a Lytic Bovine Klebsiella variicola Bacteriophage
摘要旨在对1株分离出的变栖克雷伯菌噬菌体进行生物学特性及全基因组分析.使用双层平板法从四川省某奶牛场乳样中分离、纯化出1株裂解性噬菌体,测定其裂解谱、热稳定性、酸碱耐受度、最佳感染复数及一步生长曲线等生物学特性,并进行全基因组分析,同时采用透射电镜观察噬菌体形态.结果显示,分离得到一株裂解性变栖克雷伯噬菌体vB-Kvc-Y10,噬菌斑透明且有晕环,透射电镜显示其有一丝状短尾.生物学研究结果表明,噬菌体Y10宿主特异性强,不耐高温,不耐酸,最佳感染复数为0.01.一步生长曲线结果显示:潜伏期为40 min,裂解量306.全基因组分析表明:噬菌体Y10属于自复制短尾噬菌体科,为dsDNA病毒.完整基因组大小为43 281 bp,GC含量为 56.19%,51个ORFs中有29个具有可推定的功能,且具有明显的功能分区.在Y10基因组中,没有发现tRNA和毒力基因的存在.遗传进化树和ANI分析均表明,噬菌体Y10与噬菌体vB_Kpl_K59PH2(登录号:OY757063)的亲缘关系最近.综上,本研究分离的噬菌体vB-Kvc-Y10是一株高特异性的裂解性噬菌体,不具有毒力基因,具有防治细菌感染的潜力.
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