基于GBLUP和Bayes方法的"敏盖"绒山羊绒毛性状基因组预测准确性研究
Study on the Genomic Prediction Accuracy of Cashmere Traits in"Min Gai"Cashmere Goats Using GBLUP and Bayes Methods
摘要旨在估计"敏盖"绒山羊绒毛性状的遗传参数和基因组育种值,比较GBLUP和Bayes方法对"敏盖"绒山羊绒毛性状基因组育种值预测准确性的影响,为优化"敏盖"绒山羊遗传选育策略提供参考依据.本研究以847只"敏盖"绒山羊的绒毛性状为研究对象,利用GBLUP、Bayes A、Bayes B、Bayes C和Bayes LASSO五种方法进行绒毛性状(毛长、绒厚、绒细、产绒量)遗传参数及基因组育种值的估计,进一步利用五倍交叉验证方法评价基因组育种值估计准确性.结果显示,5 种方法估计的毛长遗传力为 0.11~0.32,绒厚遗传力为 0.14~0.33,绒细遗传力为0.17~0.49,产绒量遗传力为0.16~0.32.绒厚和毛长之间存在正的强遗传相关,相关系数为0.48~0.84,其它性状间的遗传相关相对较小,为?0.06~0.46;GBLUP、Bayes A、Bayes B、Bayes C和Bayes LASSO方法估计的毛长、绒厚、绒细和产绒量的基因组育种值准确性分别为 0.623 4~0.950 9、0.626 2~0.953 0、0.830 8~0.953 1、0.741 8~0.961 4.Bayes方法估计的各性状的基因组预测准确性均显著高于GBLUP方法,Bayes B方法的基因组预测准确性最高,达0.950 9~0.961 4.综上所述,Bayes B方法被推荐用于"敏盖"绒山羊基因组选育,可能会加快种群的遗传进展.
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