换一批肉鸡屠宰场中婴儿血清型沙门菌的流行特征和全基因组分析
Epidemiological Characteristics and Whole-Genome Analysis of Salmonella enterica serovar Infantis in a Broiler Slaughterhouse
摘要旨在调查广东省某大型肉鸡屠宰场沙门菌流行特征,揭示优势血清型婴儿血清型沙门菌的基因组特征及潜在传播风险,为污染防控提供科学依据.对该屠宰场全环节采样分离沙门菌,采用琼脂稀释法检测12种抗生素耐药性.筛选34株代表性菌株进行全基因组测序(WGS),解析其血清型、多位点序列分型(MLST)、质粒和抗性基因分布,构建单核苷酸多态性(SNP)系统发育树.结合NCBI数据库10 389株全球婴儿血清型沙门菌全基因组序列,通过全基因组多位点序列分型(cgMLST)和SNP成对距离矩阵阐明婴儿血清型沙门菌潜在传播风险.结果显示:共分离到 96 株沙门菌,分离率 55.49％(96/173),掏膛环节最高(79.25％).所有分离株均呈多重耐药(MDR),耐药谱相似度高,对氨苄西林、头孢噻呋、萘啶酸、氟苯尼考和磺胺甲噁唑耐药率达100.00％,对氯霉素、四环素等的耐药率超过90％.WGS结果显示,婴儿血清型为优势血清型(32/34),以ST32为主(30/32).婴儿血清型沙门菌均含pESI巨质粒IncFIB,且携带丰富耐药基因、毒力基因、金属和消毒剂抗性基因.与全球菌株比对发现,屠宰场分离株与15株外国菌株关系密切,其中12株来源于人.该屠宰场不同环节间存在明显沙门菌交叉污染现象,分离所得MDR婴儿血清型克隆支系携带大量抗性基因,具备强大传播潜力和公共卫生风险.未来应加强针对MDR婴儿血清型沙门菌的监测与防控,尤其是屠宰环节,保障食品安全与公共健康.
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