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阿拉善型绒山羊基因组参考面板构建及绒性状基因组选择

Construction of a Genomic Reference Panel for Alxa Cashmere Goats and Genomic Selection for Cashmere Traits

二维码有效期 120s

摘要旨在构建阿拉善型绒山羊高密度填充参考面板,并对其绒纤维直径和产绒量进行基因组选择研究.本试验对健康状况良好、1～6岁的579只阿拉善型绒山羊个体进行全基因组重测序,随机选取其中50只(30只母羊、20只公羊)进行高深度重测序(测序深度为10×),其余529只进行低深度重测序(测序深度为1×),50个高深度重测序数据结合57个绒山羊下载数据(测序深度为10×)进行质控,再采用Beagle 5.2软件进行定相,GLIMPSE2软件进行基因型填充,构建高质量阿拉善型绒山羊参考面板.将低深度测序数据利用参考面板填充至高深度数据,再利用ABLUP、GBLUP、ssGBLUP法通过单性状重复力模型对绒纤维直径、产绒量进行基因组选择分析.经评估得该面板填充平均准确率达0.979.该面板解析了性别、测定年份、样本年龄、群对绒纤维直径和产绒量的影响极为显著(P＜0.01),母亲年龄对绒纤维直径和产绒量无显著影响(P＞0.05)的调控作用.用ABLUP、GBLUP、ssGBLUP法进行遗传参数的估计,经五倍交叉验证确定ssGBLUP法预测准确性(绒纤维直径:0.375±0.089,产绒量:0.347±0.082)显著优于传统方法,为计算估计育种值的最优方法,计算所得估计遗传力为绒纤维直径h2=0.42,产绒量h2=0.43.阿拉善型绒山羊育种将依托品种特异性参考面板,采用"表型初选+基因组评估"的综合策略,实现优质羊绒产业的可持续发展,同时也为其他地方品种参考面板构建提供了可鉴之处.

作者权洁 ^[1] 吴铁成 ^[2] 王涛 ^[3] 刘俊阳 ^[2] 高玉林 ^[2] 朱莉仙 ^[4] 意乐其 ^[2] 赵生国 ^[5] 刘斌 ^[2] 学术成果认领

作者单位甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070;内蒙古自治区农牧业科学院,呼和浩特 010031 ^[1] 内蒙古自治区农牧业科学院,呼和浩特 010031 ^[2] 内蒙古自治区农牧业科学院,呼和浩特 010031;肉羊遗传资源评价与繁育技术国家地方联合工程研究中心(内蒙古),呼和浩特 010031 ^[3] 阿拉善盟畜牧兽医技术推广中心,阿拉善 750300 ^[4] 甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州 730070 ^[5]

关键词阿拉善型绒山羊育种值基因组选择参考面板 Alxa cashmere goats breeding value genomic selection reference panel

分类号 S827.2

栏目名称

遗传育种

DOI 10.11843/j.issn.0366-6964.2026.04.018

发布时间 2026-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

内蒙古农牧业创新基金项目（2023CXJJM02）内蒙古自治区科技计划项目（2023YFHH0001）内蒙古引进人才科研启动支持项目