三株基因Ⅰ型新城疫病毒基因组特征分析
Genomic Characteristics Anslysis of Three Strains of Newcastle Disease Virus Type Ⅰ
摘要旨在了解我国基因Ⅰ型新城疫病毒的基因组特性,本研究对2024年从我国部分地区家禽样品中分离的3株NDV代表株进行了基因组生物信息学分析.结果显示:3株病毒基因组长度均为15 186 nt,F蛋白裂解位点序列为112GKQGRL117,符合弱毒株的分子特征.3株病毒基因组结构为3'-NP-P-M-F-HN-L-5',与新城疫病毒F和HN蛋白功能区参考序列相比,3株病毒在信号肽、融合肽、七肽重复区、跨膜区等区域出现多个氨基酸变异.3株病毒核苷酸相似性为92.4%~99.7%,其中两株鸡源分离株G2030和J2377属于基因Ⅰ.1.1亚型,与2009年印度鸡源分离株ndv60(KM056356)相似性最高(99.8%和99.9%),鸭源分离株J2180属于基因Ⅰ.2亚型,该亚型主要为野鸟分离株.贝叶斯分析显示,Ⅰ.1.1亚型毒株可能起源于澳大利亚,一直在鸡群中流行;Ⅰ.2亚型毒株可能起源于远东地区,包括2个Group,Group1在野鸟和家鸭中流行,Group2主要在野鸟中流行.本研究分析了我国家禽中分离的3株基因Ⅰ型NDV的基因组特征,证实我国家禽中流行的Ⅰ型NDV具有遗传多样性,进一步丰富了我国家禽NDV的流行病学信息.
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