牛精液样品中牛病毒性腹泻病毒的分离鉴定及基因组特征分析
Isolation,Identification and Genomic Characterization of Bovine Viral Diarrhea Virus in Bovine Semen Samples
摘要旨在调查宁夏地区牛精液样品中牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus.BVDV)带毒情况,并对分离株进行遗传演化分析.采集宁夏4个规模化奶牛养殖场100份冷冻牛精液样品,通过RT-PCR、细胞培养和透射电镜检测进行分离鉴定,TCID50测定和分离株生长曲线测定分析分离株致病性,全基因组测序和系统进化树构建进行遗传演化分析.结果表明,经RT-PCR检测100份牛精液样品中,BVDV阳性率为5%(5/100).经MDBK细胞分离出1株有典型细胞病变毒株,4株非细胞病变毒株,分别命名为BVDV-NX1-BVDV-NX5株.BVDV-NX1株经透射电镜观察病毒粒子呈球形,直径40~100 nm.经TCID50检测BVDV-NX1株病毒滴度为105.6TCID50·mL-1.经全基因测序和系统进化树分析5株分离株均为BVDV-1b型.BVDV-NX1株全长12 308 bp,包括1个ORF,编码4 033个氨基酸.BVDV-NX1株与我国BVDV-1 GX4分离株(GenBank:KJ689448.1)相似性最高,为98%.与BVDV-1 GX4分离株相比,BVDV-NX1株Npro蛋白N端编码区第261位(A/G)核苷酸发生同义突变,未导致N-pro蛋白结构域的氨基酸改变.E1蛋白N端编码区核苷酸发生突变,其中第475位(T/A)和第554位(T/C)突变导致E1蛋白结构域第159位(I→F)和第185位(L→P)氨基酸变异,第483位(C/T)核苷酸发生同义突变,未导致相应氨基酸改变.E2蛋白N端编码区核苷酸发生突变,其中第281位(A/G)突变导致E2蛋白结构域内第94位(E→G)氨基酸变异,而第30位(C/T)、第87位(A/G)和第990位(A/G)发生同义突变,未导致相应蛋白结构域氨基酸改变.综上,本研究揭示了宁夏地区牛精液样品中BVDV的流行病学特征及基因型分布,为区域性BVDV防控及种公牛精液质量监管提供了科学依据.
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