一株谱系7与谱系1.8重组的猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组特征分析
Genetic Characteristics of a Recombinant Porcine Reproductive and Virus between Lineage 7 and Lineage 1.8
摘要为分析2025年从福建省某规模化猪场临床病料中分离的1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子遗传特征,本研究对其全基因组序列进行测定,并运用相关分子生物学软件进行了基因组特性及遗传演化分析.结果显示,分离毒株FJLCA-2025基因组全长(去除polyA后)为15 520 bp,与PRRSV-2代表毒株NADC30、NADC34、QYYZ、VR2332、Prime Pac和JXA1的核苷酸相似性为85.1%~96.7%,其中与谱系7疫苗株Prime Pac的核苷酸序列相似性最高,达96.7%.基于Nsp2氨基酸序列的分析表明,FJLCA-2025存在谱系7毒株(Prime Pac-like)特征性的36个氨基酸(aa810-845)连续插入;GP5氨基酸序列比对结果显示,该分离株的大部分GP5氨基酸突变具有谱系1.8毒株(NADC30-like)的一致性;全基因组系统进化树分析显示,FJLCA-2025属于谱系7毒株,而基于ORF5基因的进化树分析则表明其属于谱系1.8毒株;重组分析结果表明,FJLCA-2025株是以谱系7 PRRSV为主要亲本毒株,谱系1.8 PRRSV为次要亲本毒株的重组毒株.综上,我国出现了谱系7变异毒株,为猪场防控PRRS带来严峻挑战,因此有必要对其开展持续监测.本研究结果为我国谱系7 PRRSV的防控提供了重要的参考依据.
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