基于杜洛克猪肠道微生物组揭示饲料报酬的社会遗传调控途径
Revealing the Regulation Pathway of Social Genetic Effects on Feed Efficiency in Duroc Pigs Based on Gut Microbiomics
摘要旨在基于16S rRNA测序技术,解析不同剩余采食量社会遗传效应(residual feed intake-social genetic effects,RFI-SGE)的杜洛克猪的肠道微生物群落差异,并筛选出与RFI-SGE相关的标志性肠道微生物菌属.本研究从209头杜洛克猪中筛选出 RFI-SGE最高或最低个体各10头作为高社会遗传效应组(HRS)与低社会遗传效应组(LRS).利用16S rRNA测序技术分析HRS组与LRS组的回肠和盲肠微生物群落结构,通过Alpha和Beta多样性分析、LEfSe分析筛选差异微生物,并结合KEGG富集分析探究其功能通路.Alpha多样性分析结果显示,HRS组与LRS组的回盲微生物群落组内多样性均无显著差异(P>0.05).Beta多样性比较获知,HRS组与LRS组存在显著的组间微生物差异(P<0.05).属水平上物种丰度结果显示,Escherichia、Stenotrophomonas、Turicibacter等在HRS组中的丰度显著高于LRS组(P<0.05),而Fusobacterium、Eubacteriumd等在LRS组中的丰度显著高于HRS组(P<0.05).最后富集分析结果表明,相较于LRS组,HRS组的谷氨酸代谢、脂肪酸生物合成、色氨酸代谢等通路显著上调(P<0.05).综上所述,杜洛克猪的RFI-SGE与肠道微生物群落的结构和功能差异密切相关,特定菌属(Fusobacterium、Escherichia等)可能通过影响谷氨酸和色氨酸代谢途径参与杜洛克猪RFI-SGE的形成与调控.本研究为揭示杜洛克猪RFI-SGE的微生物调控途径提供了新的视角.
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