青莲黑猪背膘厚校正公式参数估计与全基因组关联分析
Study on the Backfat Thickness Correction Formula and Genome-Wide Association Study in Qinglian Black Pigs
摘要旨在构建适用于青莲黑猪85~115 kg体重的背膘厚校正公式,并通过全基因组关联分析(GWAS)鉴定影响该性状的候选基因.本研究以393头同批次饲养且生长发育良好的青莲黑猪为对象,测定活体背膘厚,基于美国国家种猪改良联合会(NSIF)的校正模型框架,通过非线性最小二乘估计,求解校正系数,构建背膘厚校正公式.进一步利用66K液相芯片与群体校正背膘厚开展全基因组关联分析.建立了青莲黑猪85~115 kg背膘厚校正公式(公猪校正系数为28.192,R2=0.841 5;母猪校正系数为34.648,R2=0.725 9).在FDR<0.01水平下鉴定出10个与背膘厚显著关联的单核苷酸多态性(SNPs),分布于1、2、10和11号染色体,并通过基因注释和通路富集分析,鉴定到MAPKAP1、GRK2和LMX1B基因可能为影响青莲黑猪背膘厚性状的候选基因.本研究构建了青莲黑猪85~115 kg背膘厚校正体系并将MAPKAP1、GRK2和LMX1B作为背膘厚性状的候选基因,为地方猪种精准育种提供了理论依据和技术支撑.
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