换一批深圳犬源肠道分离细菌的耐药性与系统发育分析研究
Study on Antimicrobial Resistance and Phylogenetic Analysis of Bacteria Isolated from the Intestinal Tract of Dogs in Shenzhen
摘要犬是部分人兽共患病的动物宿主,由于生活环境和饮食习惯的不同,犬的肠道中定植着不同的微生物群落,其组成结构和耐药性的差异可能会对犬只的免疫力和病原传播产生极大影响.旨在探究深圳犬源肠道分离的霍氏肠杆菌和鸡肠球菌的耐药性和遗传进化性.在本试验中,利用宏基因组学确定了犬的肠道微生物群落组成,从其粪便样品中分离鉴定得到一株霍氏肠杆菌和一株鸡肠球菌,通过全基因组测序确定其种属.此外,还进行了耐药性分析和系统发育分析,以揭示分离株的同源性.结果表明,本试验的流浪犬肠道微生物主要以霍氏肠杆菌、屎肠球菌、鸡肠球菌和弗氏柠檬酸杆菌等细菌为主,物种丰富.该霍氏肠杆菌对氨基糖苷类、氟喹诺酮类、四环素类以及多黏菌素保持高度敏感,对青霉素和部分头孢类药物耐药.而鸡肠球菌仅保留对多数β-内酰胺类药物的敏感,对氟喹诺酮类、碳青霉烯类和甲氧苄啶表现出多重耐药.系统发育分析进一步揭示了分离菌株的ST型中与标准菌株存在高度差异性,表明菌株遗传进化的突变性.本研究是国内罕见的从犬的粪便中分离得到鸡肠球菌和ST134型的霍氏肠杆菌并解析二者全基因组数据的分析.在此基础上,本试验深入研究了其抗菌谱和遗传相似性,为进一步探索二者具体的致病性、流行传播和遗传抗生素耐药性转移机制奠定了基础,对于指导抗生素管理计划和管理、控制霍氏肠杆菌和鸡肠球菌的流行传播策略至关重要.
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关键词
霍氏肠杆菌鸡肠球菌流浪犬肠道微生物群落耐药性系统发育分析Enterobacter hormaecheiEnterococcus gallinarumstray dogsintestinal microbiotaantimicrobial resistancephylogenetic analysis
分类号
S852.61
栏目名称
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2026.06.041
发布时间
2026-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
深圳市基础研究专项(深圳市自然科学基金)面上项目（JCYJ20230807152700001）
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