换一批
换一批玫瑰根系AMF 18S rRNA基因克隆文库构建及分析
Construction and Analysis of AMF 18S rRNA Gene Clone Library in‘Rosa Carola’Roots
摘要[目的]本文研究了玫瑰根系的AMF多样性和组成结构.[方法]从昆明学院种质资源圃随机采集玫瑰‘卡罗拉’3株,采用CTAB法提取根系DNA,运用巢式PCR扩增AM真菌部分18S rRNA基因区域,扩增产物混合后构建克隆文库,最终确定30个阳性克隆子测序,并对文库进行评价和分析.[结果]文库Coverage C值为80％,但Rarefaction曲线不够饱和,应加大文库克隆子数目;文库多样性参数香农指数和辛普森指数分别为1.432和0.25,物种丰富度为4.0;以98％为界,30条序列被划分为15个OTU,均为Glomus的种类;其中OTU1是文库中的主要类型,OTU2～ OTU9代表了常见类型,而OTU10 ～OTU15为稀有类型;有10个OTU在系统进化树上单独聚类,代表着Glomus较为新颖的种类.[结论]在玫瑰根系发现的15个OTU全为Glomus的种类,其中主要类型1种,常见类型8种,稀有类型6种,具体分类地位均不清楚.
更多相关知识
分类号
S641.2
栏目名称
园艺·烟草科学
DOI
10.16213/j.cnki.scjas.2017.9.032
发布时间
2017-11-10
基金项目
云南省应用基础研究自筹基金项目
云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目
昆明学院人才引进基金项目
昆明学院校级科学研究一般项目
云南省高校特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金项目
- 浏览0
- 被引3
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
