换一批广西部分地区猪群PEDV N基因克隆及序列分析
Cloning and Sequence Analysis of N Gene of Porcine Epidemic Diarrhea Virus (PEDV) Field in Some Regions of Guangxi
摘要[目的]了解广西区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的感染及病毒的遗传变异特点,为更好防控猪流行性腹泻提供科学依据.[方法]应用RT-PCR方法从2012-2016年广西地区25个猪场收集的PEDV病料中扩增出86株PEDV的N基因,并进行序列比对及遗传进化分析.[结果]86株PEDV的N基因核苷酸同源性为94.2％～100.0％,与参考毒株核苷酸同源性为94.1％～100.0％.N基因遗传进化分析显示广西的PEDV可分为2个群,Cluster2由韩国株DR13、日本株83P-5、中国株CH/S以及本研究的GP35-8、LC37-22、LC107-5、LC107-19和LC107-16毒株组成,其他81株毒株属于Cluster 3,包括中国株DX、LJB-03、HuN、JS-2004-2;Cluster 1和Cluster 4则由其它参考毒株组成.[结论]PEDV是引起广西规模化猪场新生仔猪腹泻的主要病原,广西地区的PEDV流行毒株可分为2个群且其N基因仍然保守.
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关键词
猪流行性腹泻病毒N基因序列分析遗传进化分析Porcine epidemic diarrhea virusN geneSequence analysisGenetic evolution analysis
分类号
S828
栏目名称
DOI
10.16213/j.cnki.scjas.2018.2.032
发布时间
2018-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
桂林市科技攻关计划（20140112）
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