基于GEO筛选的心肌梗死特征性lncRNA分子标志物及实验验证研究
Identification of Characteristic lncRNA Molecular Markers for Acute Myocardial Infarction Based on GEO Database Screening and Experimental Validation
摘要目的 探讨长链非编码RNA ANRIL在急性心肌梗死(AMI)相关心肌缺血再灌注损伤(MIRI)中的调控作用,为MIRI干预提供潜在新靶点.方法 利用GEO中的AMI数据集(GSE66360)筛选差异表达基因,并采用随机森林、最小绝对收缩与选择算子、支持向量机递归特征消除 3 种机器学习算法综合筛选关键基因.通过实时荧光定量PCR、流式细胞术、细胞计数试剂盒-8、超氧化物歧化酶/丙二醛检测和蛋白质印迹法等方法,在小鼠心房心肌细胞系缺氧/复氧模型中验证关键基因ANRIL的功能.结果 共筛选出 1 127 个AMI相关差异表达基因,KEGG通路富集分析显示主要富集于炎症和凋亡相关通路(P<0.05).3 种算法交集筛选出 5 个关键基因,并构建AMI风险预测列线图,其中ANRIL与AMI显著相关.细胞实验结果显示,ANRIL在缺氧/复氧模型中显著上调(P<0.05);干扰ANRIL表达可显著降低细胞凋亡率(P<0.05),升高细胞活性(P<0.05),上调超氧化物歧化酶活性并下调MDA含量(P<0.05),同时调节B细胞淋巴瘤-2、B细胞淋巴瘤-2 相关X蛋白和胱天蛋白酶 3 等凋亡相关蛋白表达水平(P<0.05).结论 lncRNA ANRIL在AMI相关MIRI中上调表达,可能通过调节细胞凋亡与氧化应激通路促进心肌损伤,具有作为潜在干预靶点的研究价值.
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