换一批基于加权基因共表达网络分析筛选与急性心肌梗死相关的铁死亡生物标记物
Screening of ferroptosis biomarkers associated with acute myocardial infarction based on weighted gene co-expression network analysis
摘要目的:基于基因表达综合数据库(GEO)中的数据集,筛选与急性心肌梗死(AMI)最相关的共表达模块,并从中确定铁死亡相关的生物标记物.方法:对GSE123342数据集中的高变基因构建加权基因共表达网络,筛选出与AMI最相关的基因模块,并从关键模块中鉴定出铁死亡相关生物标记物,随后研究其在组织中的表达水平,并分析其与免疫微环境的相关性.结果:得到了与AMI患者最相关的1个关键模块,通过与差异基因取交集,共获得532个在AMI中上调的差异基因.功能富集分析表明,其主要富集在粒细胞迁移、活性氧生成、白细胞趋化和激活、防御反应调控等生物学过程.通路主要富集到Toll样信号通路、核因子κB(NF-κB)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、细胞因子-细胞因子受体互作通路等.最终找到了有望作为AMI治疗靶点的14个基因:锌指反义1(ZFAS1)、WD重复结构域,磷酸肌醇相互作用1(WIPI1)、Toll样受体4(TLR4)、静止蛋白巯基氧化酶(QSOX1)、同源性磷酸酶与张力蛋白同源物(PTEN)、磷酸葡萄糖酸脱氢酶(PGD)、线粒体融合蛋白2(MFN2)、双微染色体2同源基因(MDM2)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、γ-氨基丁酸受体相关蛋白样1(GABARAPL1)、花生四烯酸5-脂氧合酶(ALOX5)、长链酰基辅酶A合成酶4(ACSL4)、长链酰基辅酶A合成酶1(ACSL1).它们均与各种免疫细胞存在显著的关联.结论:与AMI相关的14个铁死亡基因有望成为潜在的免疫治疗靶点.
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10.3969/j.issn.1008-0074.2025.03.19
发布时间
2025-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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