换一批摘要预测蛋白质结构对药物设计和疾病诊断有着重要的科学意义.针对蛋白质结构从头预测问题,在进化算法框架下,提出一种距离和疏水模型辅助的蛋白质结构预测方法( Distance and Hydrophobic Model-assisted Protein Structure Prediction Meth-od,DHMA).首先根据亲疏水性构建氨基酸的回转半径来指导构象空间采样,达到提高搜索效率的目的;然后,利用距离谱构建距离分布估计模型和疏水概率模型,指导种群更新,缓解能量函数不精确带来的误差.在10个测试蛋白的预测结果表明,DH-MA具有良好的搜索性能和预测精度,是一种有效的蛋白质结构预测方法.
更多相关知识
关键词
蛋白质结构预测从头预测进化算法距离分布模型疏水概率模型protein structure predictionde novo predictionevolutionary algorithmdistance distribution modelhydrophobic probabili-ty model
分类号
TP311
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1000-1220.2019.12.004
发布时间
2020-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（61773346）
- 浏览2
- 被引10
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
