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斑马鱼肌肉Smyd1a蛋白生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Zebrafish Muscle Development with Smyd1a

摘要通过使用美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库检索出斑马鱼Smyd1a蛋白的氨基酸序列信息,对其进行生理生化分析,并通过NBCI寻找同源性高的不同种属的序列构建系统发育树.结果显示:Smyd1a蛋白的氨基酸数量是489个,分子量是56 376.54 Da,理论等电点是6.27;该蛋白中,谷氨酸(Glu)含量最高,为8.4%;其次是亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),分别为8.0%和7.0%.Smyd1a是一个亲水蛋白质,但不是一个分泌蛋白,不存在跨膜螺旋区域,存在蛋白质的无规则卷曲等构象,Smyd1a属于SET家族.

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