基于网络药理学和分子对接技术探讨山茶属植物治疗骨质疏松症作用机制
Exploring Mechanism of Camellia Plants in Treating Osteoporosis Based on Network Pharmacology and Molecular Docking Technology
摘要目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨山茶属植物治疗骨质疏松症(OP)的作用机制.方法:检索本草组鉴平台(HERB)及文献收集山茶属植物的有效成分;利用Swiss Target Prediction数据库对山茶属植物的有效成分进行靶点预测;在GeneCards数据库检索并下载OP疾病相关靶点.通过韦恩图获取山茶属植物有效成分的作用靶点及OP疾病相关靶点的共同靶点.在STRING网站中建立中药-疾病共有靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并将PPI网络输入Cytoscape3.8.1软件中进行可视化,筛选关键靶点.将共同靶点输入DAVID数据库中进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.利用Auto Dock Vina软件对核心靶点与其对应中药有效成分进行分子对接,利用Pymol软件将对接结果进行可视化展示.结果:获取山茶属植物有效成分134个,与OP疾病靶点相关的有效成分16个,包括槲皮素、山柰酚、没食子酸乙酯、水杨酸乙酯等.获取有效成分作用靶点220个,OP疾病相关靶点1 436个,两者共同靶点56个.获得核心靶点5个,包括蛋白激酶B1(AKT1)、雌激素受体1(ESR1)、环加氧酶2(PTGS2)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、基质金属蛋白酶9(MMP9).GO功能富集分析结果得到生物学过程(BP)169项,细胞组分(CC)20项,分子功能(MF)60项.KEGG通路富集分析结果得到相关信号通路65条.分子对接结果显示,5个核心靶点与其对应中药有效成分具有良好的亲和力.结论:山茶属植物治疗OP是一个多成分、多靶点、多通路参与的复杂过程.
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