换一批基于网络药理学和分子对接研究调胃安肠方治疗脓毒血症作用机制
Exploring Mechanism of Action of Tiaowei Anchang Prescription for Sepsis Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
摘要目的:运用网络药理学、分子对接以及分子动力学模拟研究调胃安肠方治疗脓毒血症的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP)预测调胃安肠方的潜在靶点,使用基因信息数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药物靶标数据库(TTD)和药物数据库(Drugbank)检索与脓毒血症相关的靶点.借助Cytoscape 3.9.1软件构建"药物-成分-靶点"网络,同时利用STRING数据库构建蛋白质互作(PPI)网络.采用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过AutoDock Vina和PyMOL进行有效成分与重要靶点的分子对接,并用Gromacs 2022.2软件对蛋白激酶B(AKT1)和β-谷甾醇进行分子动力学模拟.结果:共筛选出调胃安肠方224种有效成分和279个潜在靶点,与脓毒血症相关的靶点共3 718个,有效成分与疾病相关的共同靶点为171个,主要涉及炎症反应等生物过程,以及高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)等信号通路对脓毒血症的影响.分子对接结果显示,调胃安肠方5种活性成分(槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、柚皮素、异鼠李素)与筛选出的靶蛋白度值(degree)前10个关键靶点(c-Jun蛋白、p53蛋白、白细胞介素-6、信号转导和转录激活因子3、蛋白激酶B、人雌激素受体1、肿瘤坏死因子、核因子-κB p65亚基、丝裂原活化蛋白激酶3、丝裂原活化蛋白激酶1)均具有较好的结合活性.分子动力学模拟提示AKT1和β-谷甾醇的结合稳定且紧密.结论:调胃安肠方可通过多靶点、多途径对脓毒血症起治疗作用.
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关键词
脓毒血症调胃安肠方网络药理学分子对接分子动力学模拟作用机制Network pharmacologyTiaowei Anchang PrescriptionNetwork pharmacologyMolecular dockingMolecular dynamics simulationMechanism of Action
分类号
R285（中药学）
栏目名称
DOI
10.13457/j.cnki.jncm.2025.13.032
发布时间
2025-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
广东省中医药局科研项目（20221468）
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