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AcSDKP与TGF-β受体1相互作用的分子对接研究

Molecular docking study on the interaction of TGF-β receptor 1 and AcSDKP

摘要目的 利用分子对接方法阐释AcSDKP及其突变体多肽与转化生长因子β(TGF-β)受体1相互作用.方法 利用药物设计平台Sybyl-X2.1构建的AcSDKP及其突变体多肽的分子结构,采用Surflex分子对接方法将AcSDKP及其突变体多肽对接到TGF-β受体1中,考察它们的分子对接打分数值及相应的结合用模式.结果 AcSDKP可与TGF-β受体1形成稳定的相互作用,且以氢键相互作用为主.AcSDKP的第2位氨基酸当突变为色氨酸时(即AcSWKP)具有比原型肽AcSDKP更强的TGF-β受体1结合能力.除了AcSWKP,其他突变体在与TGF-β受体1的相互作用时要弱于AcSDKP.结论 AcSDKP可以与TGF-β受体1形成稳定的相互作用,说明AcSDKP可能是通过抑制TGF-β受体1来发挥其抗纤维化的生物活性.另外,分子对接方法预测AcSDKP的突变多肽AcSWKP可能具有更强的抗纤维化活性.

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分类号 R914
栏目名称 药物研究
DOI 10.3969/j.issn.1000-2065.2017.08.002
发布时间 2017-09-27
基金项目
江苏省自然科学基金青年项目 徐州市科技项目 徐州医科大学优秀人才科研启动基金 江苏省大学生创新创业训练计划项目 国家级大学生创新创业训练计划项目 江苏高校品牌专业建设工程资助项目
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