鸭脂联素基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析

Identification and genetic analysis of SNPs in duck adiponectin gene

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摘要以昆山麻鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭、荆江麻鸭、金定鸭,山麻鸭、龙白鸭和白羽番鸭8个鸭品种为实验材料,根据鸭脂联素基因开放阅读框序列设计5对引物,用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种群体进行群体遗传学分析.结果发现引物4扩增片段上共存有7个单碱基突变,第430、457、523处的G-A、A-G、T-C单碱基突变导致第144、153、175个氨基酸分别由丙氨酸(A)变为苏氨酸(T)、异亮氨酸(I)变为缬氨酸(V)、酪氨酸(Y)变为组氨酸(H);而C507T, T540C,C576T和C597T4个单碱基突变为沉默突变.鸭群中表现出AA、AB、AC,BB、BC、CC、DD、DE 8种基因型.8种基因型在8个鸭品种间分布存在极显著的差异(P＜0.01).除金定鸭外,其他品种均处于Hardy-Weinberg平衡状态.群体遗传分析表明金定鸭的纯合度最高,高邮鸭最低,其他各群体的纯合度较相近;金定鸭为低度多态,高邮鸭为高度多态,其他品种为中度多态.表明鸭脂联素基因不同品种中具有丰富的单核苷酸多态性,可以进一步作为候选基因来分析其与脂肪性状的相关性.

作者董飚 ^[1] 龚道清 ^[2] 孟和 ^[3] 郁建锋 ^[4] 赵旭庭 ^[5] 段修军 ^[5] 顾志良 ^[4] 学术成果认领

作者单位常熟理工学院生物系,常熟,215500;扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009 ^[1] 扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009 ^[2] 上海交通大学农业与生物学院,上海,200240 ^[3] 常熟理工学院生物系,常熟,215500 ^[4] 江苏畜牧兽医职业技术学院,泰州,225300 ^[5]

关键词鸭脂联素基因单核苷酸多态性遗传分析脂肪性状

主题词鸭(Ducks)基因(Genes)脂联素(Adiponectin)多态性, 单核苷酸(Polymorphism, Single Nucleotide)遗传(Heredity)

分类号 S8

栏目名称 研究报告

DOI 10.3321/j.issn:0253-9772.2007.08.016

发布时间 2007-09-17

基金项目

江苏省自然科学基金 江苏省高校自然科学基金