TNF-α基因多态性及其与奶牛乳房炎的相关性分析

Polymorphism of bovine TNF-α gene and its association with mastitis in Chinese Holstein cows

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摘要以417头中国荷斯坦奶牛为研究对象, 根据体细胞评分(Somatic cell score, SCS)的大小将该奶牛群体划分为感染牛群(100头)和健康牛群(317头).通过PCR-RFLP和CRS-RFLP方法检测了肿瘤坏死因子-(Tumor necrosis factor-alpha, TNF-α)基因在荷斯坦奶牛群体中的多态性, 并分析这些多态位点和奶牛乳房炎的相关性.研究发现了3个单核苷酸多态位点(Single-nucleotide polymorphism, SNP): 第2外显子39 bp处G→A的突变; 第4外显子293 bp处 C→T的突变; 5′侧翼区(5′-flanking region, 5′UTR)C→G的突变.这3个突变位点分别是DraⅠ、AfaⅠ和DdeⅠ限制性内切酶的酶切多态位点, 其中DraⅠ为创造酶切位点.经过基因型分析与χ2检验表明: 3个酶切多态位点在荷斯坦奶牛群中均未达到Hardy-Weinberg平衡状态.运用SPSS 13.0软件, 采用最小二乘拟合线性模型分析3个酶切多态位点与SCS的关系, 结果表明: AA基因型个体在DraⅠ酶切位点中的SCS显著大于BB及AB基因型个体(P<0.05), BB基因型表现出乳房炎抗性.AfaⅠ酶切位点中BB基因型个体的SCS显著大于AA及AB基因型个体(P<0.05), AA基因型表现出乳房炎抗性.DdeⅠ酶切位点中, AB基因型个体的SCS显著低于AA基因型个体(P<0.05), AB基因型为优良基因型.因此BB、AA、AB基因型分别为DraⅠ、AfaⅠ、DdeⅠ酶切位点中的优良基因型, 可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性筛选.