镜鲤体长性状的QTL定位分析
Mapping and genetic effect analysis of quantitative trait loci related to body length in mirror carp (Cyprinus carpio L.)
摘要以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体为材料,利用553个分子标记(217个SSR和336个SNP标记)对其进行基因型检测,运用JoinMap4.0软件包对遗传连锁图谱进行构建.利用MapQTL5.0区间作图法(Interval mapping)进行QTL检测,通过置换实验(1000次重复)确定连锁群显著性水平阈值.在对体长的区间定位中共检测到12个与体长性状相关的QTLs区间,分布在BL- 1-1 (SNP0137-SNP1481)、BL-4-1(SNP0092- HLJ797)、BL-5-1 (SNP 1268-HLJ423)、BL-7-1 (HLJ870-SNP0702)、BL-12-1(SNP0922-HLJ639)、BL-16-1(HLJE351- SNP0674)、BL-25-1(SNP0394-SNP0862)、BL-35-1(HLJ668-SNP0832)、BL-43-1(SNP0389-SNP1425)、BL-47-1 (HLJ057-HLJ1113)、BL-47-2(HLJ1439-HLJ1418)等11个连锁群上,解释表型变异范围是13.8%~64.9%,其中贡献率大于20%的主效QTLs有8个,是体长性状的主效QTLs区间.
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