换一批奶牛产奶性状与乳房炎相关基因CpG 含量及分布特征的比较分析
Comparative analysis on content and distribution of CpG sites in milk production traits and mastitis-related genes in dairy cattle
摘要DNA 甲基化是表观遗传学的重要组成部分,基因启动子区及第一外显子区的CpG 甲基化通常抑制该基因的表达,而去甲基化则促进基因表达.已有的研究发现荷斯坦牛的乳房炎指标SCC(Somatic cell count)与产奶量呈较强负相关.文章分析并比较了这两类性状的相关基因的启动子区、第一外显子、下游2 000 bp 序列中CpG 含量及分布特征.结果表明,乳房炎相关基因的启动子、第一外显子中CpG 含量显著低于产奶性状相关基因,而两类性状基因下游2 000 bp 序列中CpG 含量无显著性差异.另外,文中提出了两个量化基因序列中CpG 特征的指标,一个是CpG 平均距离,用来衡量序列中的CpG 分布;另一个是条件概率p(G|C),用以量化序列中二核苷酸CpG 随碱基C 出现的可能性,并对两类基因的启动子和第一外显子区域的这两个指标做了统计检验.研究结果对产奶性状与乳房炎相关基因的DNA 甲基化调控研究奠定了基础.
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分类号
S823
栏目名称
DOI
10.3724/SP.J.1005.2012.00437
发布时间
2012-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
教育部基本科研项目（2011JS006）
科研启动基金（CARS-37-04B;Z111020834）
重大项目（863;2008AA101002）
“十二五”国家科技计划农村领域项目（2011BAD28B02）
国家国际科技合作专项基金（2010-C14）
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