虾夷扇贝脂多糖诱导的肿瘤坏死因子LITAF 基因的克隆及表达分析

Cloning and expression analysis of lipopolysaccharide-induced TNF-α(LITAF) of Japanese scallop (Mizuhopecten yessoensis)

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摘要脂多糖诱导的肿瘤坏死因子(Lipopolysaccharide-induced TNF-alpha factor,LITAF)是一类重要的炎症细胞因子,在先天性免疫系统中发挥重要的介质作用.文章根据虾夷扇贝LITAF 基因EST 序列,应用RACE 技术克隆了虾夷扇贝LITAF 全长cDNA,对序列及编码的氨基酸进行生物信息学分析.结果显示,该基因cDNA 全长1 551 bp,其5′非编码区包含76 bp,3′非编码区包含1 001 bp; 开放阅读框(ORF)为474 bp,编码157 个氨基酸,氨基酸序列中存在一个保守的LITAF 结构域; 理论分子量16.99 kDa,等电点为6.24.LITAF 基因序列为3 698 bp,由3 个外显子和两个内含子组成.利用实时荧光定量PCR 技术分析LITAF 在虾夷扇贝不同组织、不同胚胎发育阶段以及鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激后各时间段的表达情况.结果表明:LITAF 基因在所检测的6 个成体组织中均有表达,其中肾脏的表达量最高; 胚胎发育的7 个时期中,担轮幼体时期表达量最高; 菌刺激36 h实验组与对照组的表达量差异大.LITAF 基因是LITAF 家族的一员,推测LITAF 基因参与虾夷扇贝的先天性免疫反应.

作者赫崇波 ^[1] 朱宝 ^[2] 刘卫东 ^[3] 鲍相渤 ^[3] 李云峰 ^[3] 单忠国 ^[4] 李宏俊 ^[5] 学术成果认领

作者单位辽宁师范大学生命科学学院,大连,116029;辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,大连,116023 ^[1] 辽宁师范大学生命科学学院,大连,116029 ^[2] 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,大连,116023 ^[3] 厦门大学海洋与环境学院,厦门,361005 ^[4] 国家海洋环境监测中心,大连,116023 ^[5]

关键词虾夷扇贝脂多糖诱导的肿瘤坏死因子序列分析胚胎发育基因表达

主题词肿瘤(Neoplasms)坏死(Necrosis)基因(Genes)胚胎发育(Embryonic Development)序列分析(Sequence Analysis)

分类号 S917.4

栏目名称

研究报告

DOI 10.3724/SP.J.1005.2012.00736

发布时间 2012-07-20

基金项目

国家海洋公益性行业科研专项（200805037）；国家自然科学基金（31140073）