换一批30个祖先信息位点的筛选及应用
The selection of 30 ancestry informative markers and their application in ancestry inference
摘要使用一组祖先信息SNPs位点(Ancestry informative markers,AIMs)可以分析某人群的遗传成分构成,推断某个体的祖先来源.文章以HapMap数据库9个人群658份样本的分型数据为基础,从30个表型相关基因的282个SNPs位点中筛选出30个AIMs位点,基于微测序-通用芯片技术构建复合检测体系,建立人群等位基因频率数据库,用于东亚、欧洲和非洲人群遗传成分描述及个体种族来源推断.使用这组位点分析HapMap数据库中658份人群样本,初步验证位点的区分效能;使用构建的体系检验5个人群194份无关个体的DNA样本;通过Structure软件分析获取人群的成分构成以及个体的遗传成分,对个体样本进行种族来源推断.结果表明:筛选的30个AIMs位点符合哈迪温伯格平衡(P＞0.01),位点之间没有连锁(r2＜0.1),658份HapMap数据库样本和194份实验样本的祖先成分分析结果与已知结果完全一致.文章筛选并建立的30个AIMs位点复合检测体系能够有效地实现东亚、欧洲、非洲人群及其混合人群的成分构成和个体遗传成分的分析,该体系可以用于法医DNA检验中个体祖先的来源推断.
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栏目名称
DOI
10.3724/SP.J.1005.2014.0779
发布时间
2014-10-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家科技支撑计划（2012BAK02B01）
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（2013JB018）
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