换一批摘要基因间长链非编码RNAs(Long intergenic non-coding RNAs, lincRNAs)是位于蛋白编码基因之间的长度超过200 nt的非编码RNAs，在动物中参与细胞周期调控、免疫监视、胚胎干细胞分化等多种生物学过程，但是lincRNAs在大多数植物中的功能尚不清楚。MicroRNAs(miRNAs)是真核生物中一类在转录水平和转录后水平介导基因沉默的21 nt左右的内源性单链小非编码RNAs分子，通过序列互补的方式调控靶标基因的表达。目前miRNAs的靶标研究主要集中于编码蛋白的基因，而对于靶标为非编码RNAs的研究较少，尤其在植物中的研究更为少见。为了系统挖掘植物中lincRNAs的功能，文章整合miRNAs数据、cDNAs数据和降解组数据，利用生物信息学方法找到拟南芥(Arabidopsis thaliana)337个成熟miRNAs在2708个lincRNAs上的可能结合位点，构建了miRNAs-mRNAs-lincRNAs调控网络，并根据竞争性内源(ceRNA)假说预测lincRNAs的功能，为进一步阐明植物中miRNAs对lincRNAs的调控机制以及lincRNAs的功能奠定了基础。
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关键词
微小RNAs基因间长链非编码RNAs降解组靶标microRNAs (miRNAs)long intergenic non-coding RNAs (lincRNAs)degradome datatargets
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DOI
10.3724/SP.J.1005.2014.1226
发布时间
2014-12-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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