换一批高粱SBP-box基因家族全基因组鉴定及表达分析
Genome-wide identification and expression analysis of SBP-box gene family in Sorghumbicolor L
摘要SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box (SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子，其功能涉及作物遗传改良的许多方面，如产量、株型、抗逆性等，具有重要的实际应用价值。本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolorL.)全基因组中鉴定出18个SBP-box基因，分布于9条染色体上，其中8个基因位于基因组重复区域。系统发育分析表明高粱 SBP-box 基因家族可分为6个亚家族，其中 SbSBP12、SbSBP3和SbSBP15分别与玉米ZmLG1、ZmTGA1和ZmUB2/3直系同源。基于RNA-seq数据的表达分析发现高粱SBP-box基因在花序原基中表达量最高，SbSBP9和SbSBP17为花序原基特异表达基因，SbSBP5、SbSBP8和SbSBP18等基因受外源ABA和PEG胁迫上调表达，表明SBP-box基因可能参与高粱对非生物逆境的响应。本研究为高粱SBP-box家族重要基因的克隆提供了参考，相关基因可作为高粱遗传改良的候选基因。
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关键词
高粱SBP-box基因家族系统进化分析表达分析Sorghum bicolorL.SBP-box gene familyphylogeneticanalysisexpression analysis
栏目名称
DOI
10.16288/j.yczz.16-008
发布时间
2016-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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