换一批基于个人计算机的进化生物学分析新时代:以eGPS为例新时代多功能软件探讨
A new era of evolutionary analysis based on a personal computer:the future of multifunctional software such as eGPS
摘要各种多组学技术所产生的大规模数据,提出了如何快速、准确地分析这些数据的重要科学问题.如何在发展创新性新理论和数学模型的基础上,基于软件工程开发出能够让用户高效且精确地处理大规模生物学数据的便捷工具,是生物信息学和计算生物学的重要研究方向.本文主要介绍了生物信息学相关软件的发展历史、基于进化生物学的应用场景和进化与组学多功能分析软件平台eGPS、计算机使用的3种方式和软件编程的3个范式,以及如何基于Conda、R语言生态与eGPS软件平台分析单基因、通路和基因组水平的数据.针对不同科学目标的用户群体,提出了软件开发、使用、维护的新思路,并对进化生物学软件应用领域的未来发展进行了展望.最后,本文提出使用个人计算机进行进化与多组学分析不仅是时代所需也是未来发展的趋势,在生物信息学分析中扮演越来越重要的角色.
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关键词
个人计算机进化生物学分析多组学分析eGPS软件平台软件开发personal computerevolutionary biology analysismulti-omics analysiseGPS software platformsoftware development
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DOI
10.16288/j.yczz.24-254
发布时间
2025-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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