换一批物种分化因素影响下的巴尔通体差异转录组分析
Differential transcriptome profiling of Bartonella spp.influenced by the species divergence factors
摘要为揭示不同种和不同宿主来源的巴尔通体(Bartonella spp.)转录水平差异及其对进化关系的影响,本研究以来自4种巴尔通体种(汉赛巴尔通体、科勒巴尔通体、克氏巴尔通体和五日热巴尔通体)和3种宿主(家猫、猕猴和人)的共27株巴尔通体菌株为研究对象,利用Illumina高通量测序技术进行转录组测序,分析不同种和不同宿主来源菌株间的基因表达差异,并比较转录组与基因组水平的系统发育分析结果的异同.结果表明,不同种和不同宿主来源的巴尔通体菌株间的基因转录水平存在明显差异,并筛选到12个可能与宿主特异性识别相关的基因(virB10、bepC和virB4等);此外,转录组核心基因(core genes)的核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)位点序列的系统发育树显示菌株呈明显的物种聚集性.通过进一步分析发现,宿主因素对巴尔通体遗传分化具有一定的作用,而地理因素对巴尔通体遗传分化的作用相对较小,与基因组核心基因SNPs位点序列的系统发育分析结果一致.本研究通过差异转录组分析揭示了巴尔通体物种间的遗传分化和系统发育关系,发现不同种和不同宿主来源的菌株间存在规律性差异.这些差异与传统基因组分析结果一致,表明转录组数据可有效用于物种间的遗传分化研究.
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10.16288/j.yczz.24-201
发布时间
2025-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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