基于宏病毒组测序技术解析异常发酵醋醪噬菌体群落结构与功能
Analysis of structure and function of phage community occurring in the abnormal fermentation of vinegar mash through virome sequencing
摘要为了探究浙江传统发酵玫瑰米醋异常发酵的原因,本研究采用Illumina Novaseq高通量测序平台测定分析了其中宏噬菌体组的种群组成、结构及相关功能注释,以期从噬菌体组学角度解析异常发酵机理.实验结果表明,异常发酵醋醪中的优势病毒科与正常发酵醋醪中的明显不同.种群网络分析和主成分分析表明,两种发酵醋醪中的噬菌体种群组成和结构有明显的差异,只有3.29%的病毒簇(viral clusters,VCs)同时存在来自两种发酵醋醪的病毒分类操作单元(viral operational taxonomic units,vOTU);且异常发酵噬菌体组的种群异质性更高,存在属水平上高度优势的噬菌体种群.较低的溶原噬菌体的占比让异常发酵醋醪噬菌体组更倾向于裂解宿主,同时异常发酵醋醪噬菌体组携带更多的细菌细胞壁水解酶也印证了这点.更重要的是,宿主-噬菌体关联性分析表明异常发酵醋醪中预测宿主细菌的群落组成与正常发酵醋醪的差异显著.综上所述,噬菌体组异常结构与功能是导致传统玫瑰醋发酵失败的主要原因之一,噬菌体组学研究为解析传统发酵食品的异常发酵原因及调控改造微生物群落提供了新途径.
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