换一批基于多类型变异的炭疽芽孢杆菌群体基因组学研究
Study on population genomics of Bacillus anthracis based on multiple types of genetic variations
摘要炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)是引发烈性传染病炭疽的病原体,也是一种典型生物战剂,主要感染牛、羊等牲畜以及人类,对畜牧业造成严重经济损失,威胁人类社会安全.深入了解该物种遗传多样性和进化推动力,是研究致病机制、开展炭疽疫情监测与防控的必要基础.但是,目前该领域研究不足,尤其缺乏基于多种类型变异的群体基因组水平研究.本文对公开发表的1,628株炭疽芽孢杆菌基因组序列进行收集和质控,在1,347株高质量序列中鉴定了 SNP、Indel、大片段获得缺失、拷贝数变异以及基因组重排等多类型变异,共发现26,635个SNP位点、9,997个Indel位点、21个大片段获得缺失事件、25个拷贝数变异以及5个倒位.系统发育重建表明,该物种可分为6个主要种群及17个亚群.综合种群多样性和地理分布特征发现,美国菌株遗传多样性最高,而非洲菌株则呈现明显的地理聚集性特征.此外,通过选择压力信号分析,发现了 4个与耐药和芽孢形成相关的基因(rpoB、fusA、spo0F、GBAA_RS11385)存在强选择压力.本研究重建了全球炭疽芽孢杆菌的种群结构,并揭示了该物种进化过程中关键的变异位点,为炭疽芽孢杆菌识别、溯源和致病机制研究提供了靶标,同时可为炭疽疫情的预防和控制提供科学支撑.
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关键词
炭疽芽孢杆菌全基因组测序遗传变异种群结构选择压力进化动力学Bacillus anthraciswhole-genome sequencinggenetic variationpopulation structureevolutionary pressureevolutionary dynamics
栏目名称
DOI
10.16288/j.yczz.24-295
发布时间
2025-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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