换一批中间偃麦草染色体2Ai-2特异PCR新标记的建立和St基因组特异序列的克隆
Development of New PCR Markers Specific to a Thinopyrum intermedium Chromosome 2Ai-2 and Cloning of the St-specific Sequences
摘要对中间偃麦草麦、小麦和小麦-中间偃麦草2Ai-2附加系Z1、Z2、Z6,代换系ZD28等进行RAPD分析,从320个RAPD引物中,鉴定出2Ai-2染色体特异的2个RAPD标记OPO05650和OPM041400.利用这2个特异RAPD引物OPO05和OPM04,PCR扩增普通小麦CS(ABD)及其近缘植物中间偃麦草(E1E2St)、拟鹅冠草(St),长穗偃麦草(E)、簇毛麦(V)、黑麦(R)、大麦(H)、粗山羊草(D)等基因组DNA.结果表明,OPO05650和OPM041400均是2Ai-2染色体上St基因组区域的特异标记.将上述2个特异片段分离回收、克隆、测序,根据测序结果重新设计、合成特异引物,成功地转换RAPD标记为SCAR(sequence characterized amplified region)标记SC-M4.利用SCAR标记对不同材料进行分析的结果表明,凡含有2Ai-2染色体的抗黄矮病材料及拟鹅冠草均产生一条扩增带,不含2Ai-2染色体的材料,包括小麦、长穗偃麦草、簇毛麦、黑麦、大麦、粗山羊草以及含有其他中间偃麦草染色体的附加系,均没有扩增产物,说明上述2个SCAR标记是中间偃麦草2Ai-2染色体的特异性PCR标记,且是2Ai-2染色体上St基因组区域的特异性标记.克隆与鉴定中间偃麦草的2个SCAR扩增片段TiSCO5和TiSCM4,结果表明,克隆的中间偃麦草TiSCO5和TiSCM4特异片段,分别是St基因组特异性的寡拷贝序列及多拷贝重复序列,为St基因组遗传研究的新探针.
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医学主题词
基因组(Genome)染色体(Chromosomes)染色体, 人, 2对(Chromosomes, Human, Pair 2)小麦属(Triticum)敏感性与特异性(Sensitivity and Specificity)
分类号
Q75（分子遗传学）
发布时间
2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家高技术研究发展计划（863计划）（J99-A-011;2001AA211011）
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