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鹿科动物线粒体控制区序列分析与系统进化

Sequence Analysis and Phylogeny of Deer (Cervidae) MtDNA Control Regions

摘要通过测定鹿科麂亚科中的小麂、赤麂和黑麂的线粒体全基因组,从而定位它们的控制区,并从GenBank获得鹿科另外3个亚科9种动物的线粒体控制区全序列.利用MEGA软件计算了各物种控制区序列的碱基组成、遗传距离和遗传相似度,通过比较序列同源性,以羊线粒体控制区序列为外群,构建NJ分子系统树,探讨了鹿科4个亚科12种动物的系统进化关系.序列分析表明,鹿科12种动物控制区序列的碱基长度在909~1049 bp之间,A+T含量约占62.06%,其中363个核苷酸位点存在变异(约占34%).系统进化关系结果表明:(1)以线粒体控制区构建的鹿科12种动物分子系统树基本与NCBI分类一致;(2)美洲鹿亚科驼鹿属驼鹿在鹿科这12种动物中处于最为原始的地位;(3)小麂比赤麂和黑麂更为原始;(4)獐亚科獐属的獐与美洲鹿亚科狍鹿属的狍鹿和美洲狍鹿聚为一支.

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遗传学报

遗传学报

2004年31卷4期

395-402页

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