换一批
换一批3大种群蛋白质内部重复片段组成规律的比较研究
Comparative Analysis of Internal Repeating Segments in Proteins of Species from the Three Kingdoms of Life
摘要20世纪70年代,Ohno提出了功能蛋白的起源理论,认为寡肽片段的周期性重复是蛋白质起源的一种方式. 蛋白质内部重复片段在蛋白质序列进化的过程中具有重要意义.选取原核生物、古细菌、真核生物的8个代表物种,设计了新的蛋白质内部重复片段的提取方法,并用矩阵的方式对重复片段的类型及其出现的频率进行形象地展现,既保留了重复片段的序列特征又可进行全局性的统计描述.分析表明:真核生物高频率的使用简单重复序列;真细菌也具有低频率使用简单重复序列的现象;而古细菌则几乎没有.进一步研究显示,3大种群生物偏向性使用氨基酸构成蛋白质内部重复片段的形为与蛋白质组的氨基酸使用频率紧密相关.其相关系数在真细菌和古细菌中高于0.95,而真核生物略低.真核生物蛋白质组大量使用简单重复片段,以及两者在氨基酸使用上的较低相关性暗示简单重复序列的快速进化是导致真核生物蛋白质组高复杂性的一个关键因素.
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