换一批RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因
Identification of Potential Genes Regulated by DNA Methyltransferase 3B in a Hepatocellular Carcinoma Cell Line by RNA Interference and Microarray Analysis
摘要为揭示DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)在肝癌中是否参与了肿瘤的发生,应用Western blotting及细胞免疫化学方法分析DNMT3B蛋白在人的正常肝细胞株、肝癌癌旁细胞株及肝癌癌细胞株中的表达.构建了DNMT3B 的RNAi稳定表达的重组载体,并转染入肝癌细胞株SMMC-7721中.以半定量RT-PCR及Western blotting分别鉴定DNMT3B RNAi表达载体对内源性DNMT3B的抑制效率.用高通量的cDNA基因芯片分析了SMMC-7721中DNMT3B抑制后有影响的下游基因谱.结果显示,DNMT3B在肝癌细胞株中的表达水平明显高于肝癌癌旁和正常肝细胞株.DNMT3B的RNAi稳定表达重组载体转染SMMC-7721细胞株2个月后,观察到DNMT3B明显受到抑制.cDNA基因芯片分析发现,DNMT3B抑制后诱导26条基因表达下调,115条基因表达上调,包括一些发育相关基因以及肿瘤相关基因,如SNCG、NOTCH1、MBD3、WNT11、MAOA、FACL4等.提示DNMT3B的高表达可能与肝癌的发生有关,并以调控其他相关基因的表达而起作用,包括与发育相关的重要基因.
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分类号
R735.7（消化系肿瘤）
栏目名称
发布时间
2005-12-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划（(2001/182)）
中国科学院资助项目（(30470950)）
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