换一批
换一批2株创伤弧菌的16S-23S rDNA间区的克隆、测序及分析
Cloning, Sequencing and Analysis of the 16S-23S rDNA Intergenic Spacers (IGSs) of Two Strains of Vibrio vulnificus
摘要根据细菌的16S rDNA 3'端和23S rDNA 5'端的高度保守区设计引物,PCR扩增了2株创伤弧菌(Vibrio vulnificus)的16S-23S rDNA间区(Intergenic spacer,IGS),克隆到pGEM-T载体上,测序.用BLAST和DNAstar软件对16S-23SrDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析.结果表明,2株创伤弧菌共测出9条16S-23S rDNA间区序列,其中ZSU006测出5条,间区类型分别为:IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSA和IGSG.其中IGSGLAV最大,包含tRNAGlu、tRNALys、tRNAAla和tRNAVal基因;IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因;IGSIn,则包含tRNAIle和tRNAAla基因;IGSG仅包含tRNAGlu基因;而IGSA仅包含tRNAAla基因.菌株CG021测出的16S-23S rDNAIGS序列有4条,除缺少IGSA外,其余的IGS类型均与ZSU006的相同.与GenBank内的创伤弧菌ATCC27562的IGS序列比较,发现创伤弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性.16S-23S rDNA间区结构的差异为建立一种新的创伤弧菌检测方法奠定了基础.
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关键词
创伤弧菌16S-23S rDNA间区tRNA基因克隆序列分析Vibrio vulnificus16S-23S rDNA intergenic spacerstRNA genecloningsequence analysis
分类号
Q933
栏目名称
发布时间
2006-04-25
基金项目
国家科技攻关项目（2001AA622020）；
Special Research Grant from the Sciences and Technology Bureau of Guangdong Province（2KB05301N）；
湖南科技大学校科研和教改项目（E50437）
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