秦川母牛群体遗传特性的微卫星标记研究

Study on Population Genetic Characteristics of Qinchuan Cows Using Microsatellite Markers

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摘要为了从DNA分子水平揭示秦川牛群体遗传多态性和群体遗传结构,寻找可用于秦川牛的微卫星标记,本研究选择了12个普通牛(Bos taurus)微卫星标记检测了90头秦川母牛各微卫星位点的遗传变异及多态性.结果表明,在秦川母牛群体中,12个微卫星位点共检测到了247个等位基因,各位点的等位基因数在13(INRA005)～33个(HEL13)之间,平均每个微卫星位点的等位基因数为21个;总有效等位基因数和平均每个位点平均有效等位基因数(Ne)分别分为142.6229和11.8852.各位点平均基因频率取样方差(V (pij))为2.6036×10-4.12个微卫星位点平均观察杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)在0.7842(INRA005)～0.9775(BM315)和0.7952(BM315)～0.9446(HEL13)之间.12个位点平均多态信息含量(PIC)在0.7653(INRA005)～0.9420(HEL13)之间,平均为0.8965.12个微卫星位点均属于高度多态位点,这表明秦川母牛群体中所检测各微卫星位点具有丰富的遗传多态性,具备较大的选择潜力.12个微卫星位点的平均固定指数(F)为-0.0076,即各位点杂合子的缺陷度不高,即偏离Hardy-Weinberg平衡的程度不大.