换一批苏云金杆菌Vip蛋白经历正向达尔文选择的证据
Evidence for Positive Darwinian Selection of Vip Gene in Bacillus thuringiensis
摘要营养期杀虫蛋白(Vip)是苏云金杆菌在营养期所产生的一类新型杀虫蛋白,代表了第二代转基因杀虫蛋白,它能在一定程度上克服许多害虫对δ-内毒素低敏感或者不敏感的缺陷.但是,目前和已经深入研究的δ-内毒素相比较,有关Vip蛋白结构和功能关系方面的报道还甚少.本文采用最大似然方法和基于最大简约的滑窗分析对Vip蛋白的分子进化机制进行了评价.结果发现Vip蛋白在进化过程当中经历了正选择,并采用贝叶斯方法确定了16个正选择氨基酸残基.有意思的是所有这些正选择残基都位于Vip蛋白C端从705到809的区域.当把这些正选择残基定位到二级结构和三级结构时,发现绝大部分正选择残基都暴露在Vip蛋白空间结构的表面并且聚集在环的区域.推测Vip蛋白分子进化的机制应该是受到了正选择压力而不是功能约束的松弛.导致Vip蛋白C端多样性的潜在正选择压力可能是Vip蛋白为了在和目标昆虫之间竞争取得优势,或者是为了扩大Vip蛋白的杀虫范围.文中确定的经历了正选择残基很有可能是和昆虫宿主范围有关,因此可以为今后研究Vip蛋白的结构和功能提供相应的靶点.
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关键词
苏云金杆菌正选择滑窗分析最大似然Vip蛋白Bacillus thuringiensispositive selectionsliding windowmaximum likelihoodVip proteins
分类号
Q5（生物化学）
栏目名称
发布时间
2007-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（30571009）
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