猪GATA-3基因的电子克隆、表达及其分子进化分析
In Silico Cloning, Expression and Phylogenetic Analysis of Pig GATA-3 Gene
摘要基于猪的表达标签数据库电子克隆了猪的GATA-3基因,并通过RT-PCR验证了猪的GATA-3基因的核苷酸序列.测序结果显示猪的GATA-3基因的核苷酸长度由1,760 bp个碱基组成,包括1,335 bp的开放阅读框,编码产物为由444个氨基酸残基组成的多肽.通过半定量RT-PCR检测了GATA-3 mRNA在大白猪的各个组织的表达情况.GATA转录因子家族通常有2个Ⅳ型锌指蛋白结构,根据Ⅳ型锌指蛋白结构序列,使用Mega3.1软件构建了分子进化关系树.系统发育分析表明所有的脊椎动物的GATA转录因子都起源于共同的祖先,拓扑结构也表明进化过程中有多种事件发生,包括基因复制和Ⅳ型锌指蛋白结构域重组,根据所得数据有利于进一步了解GATA家族基因趋同和趋异的进化途径.
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