换一批北京市朝阳区腹泻人群沙门菌基因组特征分析
Analysis on genomic characteristics of Salmonella in a diarrhoeal population in Chaoyang district,Beijing city
摘要目的 用全基因组测序技术分析2021年北京市朝阳区人源39株沙门菌血清型、耐药基因和毒力基因携带情况.方法 应用常规检测法,对2021年北京市朝阳区疾病预防控制中心微生物检验科检出的39株沙门菌进行血清分型和药敏实验;同时对分离菌株进行全基因组测序,应用SeqSero、CARD和VFDB数据库分别进行血清型、耐药性和毒力基因携带情况的预测,对常规检测法和全基因组序列分析法得到的血清型数据进行比较;分析耐药基因和毒力基因的携带情况.结果 2021年北京市朝阳区腹泻患者粪便中检出的沙门菌血清型主要为肠炎沙门(51.28％)和鼠伤寒沙门菌i相变种(17.95％);39株沙门菌共检测到10类44种耐药基因,多重耐药外排泵蛋白抗性基因MdtK和多重耐药调控基因SdiA携带率100％;VFDB数据库毒力因子预测共发现120种3 867个毒力因子.20株肠炎沙门菌中检出的毒力因子种类、数目高于其他血清型沙门菌.结论 全基因组测序有助于沙门菌罕见血清型的鉴定.2021年北京市朝阳区沙门菌多重耐药情况严重,携带的耐药基因和毒力因子种类多且复杂,在疾病防控工作中需要持续监测.
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分类号
R512.5（传染病）
栏目名称
DOI
10.16406/j.pmt.issn.1672-9153.2024.4.09
发布时间
2024-07-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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