换一批
换一批COL1A2在头颈部鳞癌中的差异表达及功能分析
Differential expression and functional prediction of COL1A2 in head and neck squamous cell carcinoma
摘要目的 采用生物信息学方法探讨COL1A2 在头颈部鳞癌(HNSC)中的表达及相关功能.方法 利用TIM-ER2.0 数据库分析COL1A2 基因在泛癌中的表达;通过GEPIA数据库、UALCAN数据库分析该基因在HNSC与正常组织中的差异表达情况;并利用STRING数据库构建COL1A2 基因蛋白互作网,DAVID数据库分析与该基因互作蛋白基因的相关功能;最后通过GCBI基因雷达数据库预测该基因可能参与的调控网络和转录因子.结果 COL1A2在多种肿瘤中高表达,且在头颈部鳞癌组织与正常组织中有差异表达.COL1A2 及相关蛋白基因功能富集分析发现其参与了 4 个细胞组分、5 个分子功能、11 个生物学程序、7 条信号通路,在基因调控网及转录因子预测发现,COL1A2 与多种蛋白、转录因子、lncRNA、micRNA等相互调控.结论 COL1A2 与HNSC的发生、发展可能是通过PI3K-Akt信号通路等多种途径、多种蛋白、转录因子共同调控的结果.
更多相关知识
分类号
R739.91
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1003-1383.2024.02.004
发布时间
2024-04-03
基金项目
大学生创新创业训练计划自治区级立项项目（S202210599011）；
大学生创新创业训练计划自治区级立项项目（S202210599096）；
大学生创新创业训练计划自治区级立项项目（S202210599050）；
大学生创新创业训练计划自治区级立项项目（S202110599074）；
右江民族医学院校级科研课题（yy2018ky015）
- 浏览10
- 被引0
- 下载3
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
