换一批肺腺癌中核黄素转运体2基因和蛋白表达及功能的生物信息学分析
Bioinformatics analysis of the expression and function of riboflavin transporter 2 in lung adenocarcinoma
摘要目的 探讨核黄素转运体2(RFT2)在肺腺癌中的表达、预后意义及其生物学功能.方法 检索GEPIA数据库中有关肺腺癌的数据,分析肺腺癌组织与癌旁组织中RFT2 mRNA表达的差异.采用Kaplan-Meier方法分析RFT2高、低表达组肺腺癌患者总生存时间(OS)、无病进展生存时间(DFS)的差异.利用The Human Protein At-las分析肺腺癌组织和正常肺组织中RFT2蛋白表达的差异.通过String和WebGestalt数据库分析与RFT2表达相关的蛋白及其生物学功能.结果 肺腺癌组织中RFT2 mRNA的表达水平明显高于正常肺组织,差异有统计学意义(P<0.01).不同分期肺腺癌组织中RFT2 mRNA表达比较差异无统计学意义(P>0.05).RFT2 mRNA高表达患者OS缩短(HR=1.4,P<0.05),DFS无明显改变(HR=1.0,P>0.05).The Human Brotein Atlas数据库分析显示,肺腺癌组织RFT2蛋白呈高表达.String及WebGestalt分析发现,与RFT2基因相关的蛋白主要位于细胞膜中,参与细胞的生物调节、代谢和蛋白、离子的结合过程.结论 RFT2在肺腺癌组织中呈现高表达,与肺腺癌预后差相关,有可能成为肺腺癌重要治疗靶点.
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