宏基因组二代测序在糖尿病合并社区获得性肺炎患者中的诊断价值
Diagnostic value of metagenomic next-generation sequencing in patients with diabetes mellitus combined with commu-nity-acquired pneumonia
摘要目的 比较宏基因组二代测序(mNGS)对糖尿病(DM)合并社区获得性肺炎(CAP)患者病原学检测的诊断价值.方法 回顾性选取2021年7月—2024年12月在新疆医科大学第一附属医院呼吸中心就诊的DM合并CAP患者134例的临床资料,患者均接受传统微生物学检测(CMTs)及mNGS检测.采用受试者工作特征(ROC)曲线评估并比较2种检测方法在DM合并CAP患者中的敏感度与特异度、阳性预测值(PPV)和阴性预测值(NPV),评价2种检测方法病原体分布及检出结果的一致性,并计算混淆矩阵参数.结果 mNGS检出感染病原体的敏感度高于CMTs(x2/P=9.481/0.002),2种检测方法的AUC、特异度、PPV、NPV比较差异无统计学意义(P>0.05);在病原体检出方面,mNGS最常检测出的细菌为结核分枝杆菌(19例),最常检测出的病毒为人疱疹病毒(66例);通过CMTs检测出的病原体阴性43例中,行mNGS检测出病原体阳性30例;DM合并CAP患者行mNGS检测,单一感染发生率为31.34%(42/134),混合感染的发生率为51.49%(69/134),其中最为常见的混合感染类型为细菌—病毒感染28.99%(20/69).结论 mNGS能够提高DM合并CAP的病原体检出率,有效增加罕见、特殊病原体的检测效能,为抗感染治疗方案的制订提出合理化建议.
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