换一批藓类植物DNA条码的初步研究——以蔓藓科部分属为例
The Preliminary Study on DNA Barcoding of Mosses——A Case of Part of Genera of Meteoriaceae
摘要选取7个叶绿体基因片段,其中3个编码区基因片段(matK,rps4 and rbcL-a)和4个非编码区基因片段(atpB-rbcL,atpF-H,psbK-I and trnH-psbA),一个线粒体基因片段(nad5)和一个核基因片段(ITS2),材料包括5个属14个种的74份样品.分析比较了6个基因片段的多样性、种内和种间的遗传距离、鉴别率等.结果显示,在使用单个片段时ITS2的鉴定效果最好,而atpB-rbcL则是叶绿体基因片段中鉴别能力最高的.使用组合片段的结果发现,两个基因片段组合的鉴别效果最好.通过NJ树的方法检验,atpB-rbcL+trnH-psbA和rbcL-a++trnH-psbA的鉴定成功率是64%,当再增加一个或两个基因片段时其鉴定效果并没有提高.本研究表明在植物中应用DNA条码需要用质体基因和核基因联合.
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DOI
10.3724/SP.J.1143.2010.09234
发布时间
2010-07-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科技资源平台项目（2005DKA21401）
中科院植物所（KSCX2-YW-Z-0807）
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