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V.PhyloMaker2:An updated and enlarged R package that can generate very large phylogenies for vascular plants

摘要An earlier version of V.PhyloMaker has been broadly used to generate phylogenetic trees of vascular plants for botanical,biogeographical and ecological studies.Here,we update and enlarge this package,which is now called'V.PhyloMaker2'.With V.PhyloMaker2,one can generate a phylogenetic tree for vascular plants based on one of three different botanical nomenclature systems.V.PhyloMaker2 can generate phylogenies for very large species lists(the largest species list that we tested included 365,198 species).V.PhyloMaker2 generates phylogenies at a fast speed.We provide an example(including a sample species list and an R script to run it)in this paper to show how to use V.PhyloMaker2 to generate phylogenetic trees.

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作者 Yi Jin [1] Hong Qian [2] 学术成果认领
作者单位 Key Laboratory of National Forestry and Grassland Administration on Biodiversity Conservation in Karst Mountainous Areas of Southwestern China,Guizhou Normal University,Guiyang,550025,China [1] Research and Collections Center,Illinois State Museum,1011 East Ash Street,Springfield,IL,62703,USA [2]
栏目名称
发布时间 2022-09-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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植物多样性(英文版)

植物多样性(英文版)

2022年44卷4期

335-339页

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