换一批基于网络药理学与分子对接探究荆芥-防风药对防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制
Mechanism of Schizonepetae Herba-Saposhnikoviae Radix on the Prevention and Treatment of COVID-19 Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
摘要目的:采用网络药理学与分子对接法探究荆芥-防风药对防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法:借助中药系统药理学分析平台TCMSP检索荆芥与防风的化学成分与作用靶标,采用Uniprot数据库查询各靶标对应的基因.通过String进行GO富集分析与KEGG通路富集分析,预测其作用机制.通过Omicshare绘制气泡图,运用Cytoscape软件构建化合物-靶标-通路网络并进行可视化分析.利用CB-Dock对核心活性化合物与COVID-19的3 CL水解酶及ACE2进行分子对接.结果:以口服利用率OB≥30％,类药性DL≥0.18为活性化合物筛选条件,从荆芥-防风药中筛选出27个活性成分和212个靶标,与350个COVID-19相关靶标的交集靶标共有47个.其中,核心靶标25个,包含IL6、TP53、CASP3、MAPK1、CXCL8、CCL2等.核心化合物包括槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、β-谷甾醇等.GO富集得出1381条结果,其中生物过程1210条,细胞组成54条,分子功能117条.KEGG通路富集得到相关通路160条,提示荆芥-防风药对可能作用于多条炎症、免疫、病毒感染相关通路,发挥防治COVID-19的作用.结论:通过网络药理学结合分子对接预测了荆芥-防风药对可通过槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、β-谷甾醇等活性化合物,介导多条免疫、炎症、感染相关通路,进而发挥防治COVID-19的作用.
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